Участие сотрудников Университетской клиники в интенсиве Института биоинформатики
26.05.2017
Сотрудники лаборатории биоинформатики и интеллектуальных методов обработки биомедицинских данных Университетской клиники Демидов А.В. и Власов В.В. 17-19 апреля приняли участие в Интенсиве института Биоинформатики на базе Академического университета (СПбАУ РАН) при поддержке компаний JetBrains, ParseqLab и лаборатории алгоритмической биологии СПбАУ РАН в г.Санкт-Петербург.
Трёхдневный интенсив был построен по модульной системе: в каждой части последовательно рассматривались отдельные стадии ведения геномного проекта. Бóльшую часть курса занимали практические занятия. К участию были приглашены исследователи биологических и смежных направлений, заинтересованные в изучении методов ведения геномных проектов. Участники интенсива из Москвы, Санкт-Петербурга, Томска, Орла, Тулы, Минска (Республика Беларусь), Неймегена (Нидерланды) получили знания о способах и приёмах работы с геномными данными (прокариотическими и эукариотическими), а также освоили все важнейшие программные средства на практике. Итогом интенсива был самостоятельный геномный проект, выполненный под контролем ведущих специалистов в области биоинформатики (включающий все основные этапы: от контроля качества секвенирования до поиска и аннотирования генов). Крайне интересным оказалось занятие, связанное с поиском мутаций в геноме человека, обусловливающих тяжелое заболевание - муковисцидоз.
Занятия были построены с чередованием теоретических и практических занятий, что позволило освоить достаточно сложные программные средства в ограниченный срок интенсива.
Выполнение итогового геномного проекта позволило проверить полученные навыки на реальных данных.
Следует отметить организацию интенсива, она оказалась на высоте: продуманные методические указания и учебные материалы, облачные рабочие места с предварительно настроенным программным обеспечением.
Темы: Наука