Кафедра гистологии, цитологии и эмбриологии МИ ОГУ существует с февраля 1999 года. Кафедра состоит из ряда учебных кабинетов, оборудованных по музейному типу и посвящённых деятельности А.И Бабухина и Ю. И. Афанасьева, музея истории развития микроскопии, библиотеки, специализированной лекционной аудитории, позволяющей демонстрировать учебные фильмы и гистологические препараты. Создана научная лаборатория, в которой изготавливают гистологические препараты не только для научных исследований, но и для учебного процесса. С 2004 года при кафедре открыта аспирантура. В настоящее время, с 01 августа 2021 заведующим кафедрой является доктор медицинских наук, профессор Затолокина Мария Алексеевна. На протяжении 18 лет (с 02.04.2002 года по 30.06.2020) кафедрой заведовал академик РАЕН, доктор медицинских наук, профессор Ноздрин Владимир Иванович. С 01.07.2020 по 30.07.2021 года временно исполняла обязанности заведующего кафедрой к.м.н., Горбунова Марина Вячеславовна. Учебные дисциплины кафедры: гистология, эмбриология, цитология; медицинская эмбриология; биология; ботаника. Сотрудники кафедры: к.м.н., доцент Мишина Е.С., к.м.н., доцент Горбунова М.В., к.б.н., доцент Скребнева Е.Н., к.б.н., доцент Савончик Г.С., к.б.н., доцент Клеймёнов И.С., старший преподаватель Горпинич И.В., старший преподаватель Салмин С.А.